Sono mutanti, esseri umani geneticamente dotati - il gruppo minoritario più recente e perseguitato al mondo. In un clima crescente di paura e bigottismo, un individuo illuminato, il professor Charles Xavier, ha creato un rifugio sicuro per alcuni di questi potenti emarginati. Ai mutanti qui viene insegnato a sfruttare le loro abilità uniche per il miglioramento della razza umana. Combattono contro le agenzie governative ostili e il suprematista mutante Magneto e le sue fazioni, che cercano di distruggere la razza umana.